Investigación
Epidemiología molecular de la tuberculosis
Equipo Científico

INVESTIGADOR PRINCIPAL
Sofía Samper

EQUIPO
Mª José Iglesias, Isabel Otal, Jesús Gonzalo, Carlos Lampreave y Alberto Cebollada

Actividad principal del Grupo de Investigación
El grupo participa en la vigilancia molecular de la tuberculosis en la CCAA de Aragón y de la tuberculosis (TB) multirresistente (MDR) en España, coordinada desde ECDC, para los que es punto de contacto (OCP) para el genotipado de M. tuberculosis. Caracteriza las cepas especialmente transmitidas en la población española, que incluye la secuenciación de sus genomas. Estudia la resistencia y filogenia. Participa en la formación continuada de estudiantes y personal del sistema nacional de salud. Asesora estudios de epidemiología molecular de otros microorganismos realizados en HUMS.
Centro

 

Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud

Líneas de investigación

Epidemiología molecular de la tuberculosis

Programas

Enfermedades infecciosas e inflamación

Artículos publicados

Sagasti S, et al. In-depth analysis of the genome sequence of a clinical, extensively drug-resistant Mycobacterium bovis strain. Tuberculosis (Edinb).100:46-52 (2016)

Nebreda T,  et al. Peritoneal tuberculosis due to Mycobacterium caprae. IDCases. 5;4:50-2 (2016)

Nikolayevskyy V, et al. External Quality Assessment for Tuberculosis Diagnosis and Drug Resistance in the European Union: A Five Year Multicentre Implementation Study. PLoS One. 7;11(4):e0152926(2016)

Molina-Moya B , et al. Evaluation of GenoFlow DR-MTB Array Test for Detection of Rifampin and Isoniazid Resistance in Mycobacterium tuberculosis. J Clin Microbiol.;54(4):1160-3 (2016)

Millán-Lou MI, , et al. Mycobacterial diversity causing multi- and extensively drug-resistant tuberculosis in Djibouti, Horn of Africa. Int J Tuberc Lung Dis. 20, 150-153 (2016)

Proyectos activos

FIS 12/1970 Polimorfismos genómicos y transcriptómicos en M. tuberculosis complex y su significado en la clínica y 15/0317 Análisis de las diferencias de IS6110 entre los miembros del complejo y  el papel  de  su localización en el origen de replicación.

Actividad y Resultados más relevantes

Se ha publicado el análisis genómico de una cepa M. bovis extremadamente resistente que afectó en España de forma letal a más de 200 casos. Los resultados obtenidos de la secuencia genómica de esta cepa epidémica llamada M. bovis B, da explicación del fenotipo de resistencia de la cepa además de ofrecer la clave para identificar cambios estructurales para explicar la difusión exitosa de esta cepa entre la población. En la publicación se ofrecen todas las variantes del genoma encontradas con respecto a la cepa de referencia M. bovis AF2122/97, datos que podrán ser utilizadas por la comunidad científica para futuras investigaciones.

Así mismo ha sido importante el inicio de trabajo en la técnica de secuenciación genómica y de Ampliseq en detección de resistencias y filogenia utilizando la plataforma de nuestro Servicio Científico Técnico de Secuenciación y Genómica Funcional. Si bien la secuenciación del genoma completo no es factible por el momento como una herramienta de rutina para la investigación de brotes, desde la Nueva RED-europea Laboratorios  de Tuberculosis (ERLTB-Net) se ha incluido entre los métodos de tipificación y ha realizado el control de calidad. Nuestro grupo ha participado por primera vez en esta ronda de calidad en la que hemos obtenido óptimos resultados.

Otras actividades relevantes de 2016, han sido: la publicación de un estudio de colaboración de los resultados de la caracterización de aislados multirresistentes de Yibuti, de un hospital a donde acuden los pacientes que llevan una mala evolución. Entre estos aislados se encontró una gran  variabilidad genética por lo que se concluye que no hay transmisión de las cepas en su forma multirresistente, sino que e necesario potenciar el mejor tratamiento de la enfermedad; la colaboración en la identificación de un aislado M. caprae que afectó de forma sistémica a un paciente pediátrico; y la colaboración con el grupo del Dr. Domínguez en mejorar la identificación de resistencias de M. tuberculosis.

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