Epidemiología genética de las enfermedades gastrointestinales de carácter Inflamatorio y neoplásico

Grupos de investigación

La Secuenciación de Nueva Generación (NGS) permite cartografiar la arquitectura oculta de las enfermedades multifactoriales y liderar el camino hacia la medicina de precisión

Equipo Científico

INVESTIGADOR PRINCIPAL

Mª Asunción García González

EQUIPO

Mark Strunk

Patricia Carrera Lasfuentes

Samantha Arechavaleta Tabuenca

Investigadores asociados: Federico Sopeña, Carla Gargallo, Vega Rodrigálvarez, Rocío Aznar, Rafael del Hoyo, Luis Bujanda, Enrique Quintero, Mª Ángeles Pérez Aísa, Leticia Moreira, Koldo García, David Nicolás, Johannes Schumacher, Timo Hess.

Actividad del grupo de investigación

La investigación en epidemiología genética se centra en el hallazgo de variantes genéticas de riesgo asociadas al desarrollo de enfermedades complejas y al estudio de las interacciones con factores ambientales. Con ello se pretende identificar aquellos individuos susceptibles de desarrollar una determinada patología o presentar un peor pronóstico en su evolución y que, por tanto, pueden beneficiarse de un seguimiento más detallado o una actuación terapéutica precoz.

Nuestro grupo trabaja en estrecha relación con un equipo multidisciplinar formado por investigadores clínicos y básicos de diversos centros nacionales e internacionales cuyo trabajo conjunto y sostenido a lo largo de los años ha permitido abordar desde el punto de vista de la epidemiología genética, patologías tan complejas y multifactoriales como son las enfermedades asociadas a la infección por Helicobacter pylori, el cáncer de colon, la enfermedad inflamatoria intestinal o la hemorragia digestiva aguda.

Centro

Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud

Programas

Digestivo

Líneas de investigación

Epidemiología genética de las enfermedades gastrointestinales de carácter Inflamatorio y neoplásico

Actividad y resultados más relevantes del año

Hallazgos o resultados relevantes del año

Englobado dentro de la ejecución del proyecto FIS PI22/00537, hemos completado la secuenciación del exoma en 100 pacientes con adenocarcinoma gástrico primario diagnosticados en Aragón y 100 sujetos control con el fin de identificar variantes de riesgo de cáncer gástrico y analizar sus interacciones con factores ambientales.

La secuenciación del exoma se ha realizado mediante tecnología NGS por medio de la plataforma NovaSeq 6000 utilizando el panel Twist Exome 2.0 (NOVOGENE). Una vez finalizado el análisis bioinformático, seleccionamos aquellos SNPs con una profundidad mínima de lectura de 10X, una calidad de genotipado ≥ 50%, una MAF > 5% y un equilibrio de Hardy–Weinberg (HWE) p > 1.0 X 10-4 para la población control. El análisis EWAS se realizó utilizando la herramienta PLINK2 aplicando los modelos de herencia dominante, recesivo y aditivo. De las ≈ 30.000 variantes que se incluyeron en el estudio EWAS, 16 SNPs se asociaron de forma significativa con el riesgo de desarrollar CG tras aplicar la corrección por análisis múltiple.

En relación al pronóstico, se realizó un análisis de riesgos proporcionales de Cox, ajustado por sexo y edad. Ocho SNPs se asociaron de forma significativa (p <1e-5) con una mayor o menor supervivencia en los 4 tramos temporales analizados. El hallazgo de nuevas variantes genéticas nos permitirá evaluar el efecto de la inclusión de un score genético en los modelos de predicción de riesgo y pronóstico de CG en España. También, y englobado dentro del proyecto European staR project on gastric cancer research (https://www.star-project.md) se han publicado los resultados del mayor estudio europeo basado en la secuenciación del exoma en pacientes con CG precoz (< 50 años).

Aproximadamente, un 3% de los pacientes presentaban variantes monogénicas de CG en los genes CDH1 y ATM por lo que se recomienda secuenciar el gen ATM, además de otros genes identificados previamente, ante la sospecha de una forma monogénica de CG (Eur J Hum Genet 2025. Doi: 10.1038/s41431-025-01994-8).

Proyectos principales activos durante el año 2025

European staR project on gastric cancer research (https://www.star-project.md).
Proyecto Acción Estratégica en Salud ISCIII (PI22/00537): Evaluación del riesgo y pronóstico del cáncer gástrico mediante un score genético basado en el análisis del exoma. Interacción con factores ambientales e infección por Helicobacter pylori. IP: Mª Asunción García González. Cuantía: 171.820 €.

Formación

Tutorización de alumnos del Grado de Biomedicina para la realización de prácticas extracurriculares. Universidad San Jorge.

Divulgación

Participación en el programa de divulgación científica “La curiosidad salvó al gato” en el capítulo “Genes y sostenibilidad” emitido por la cadena autonómica de televisión ARAGÓN TELEVISIÓN. https://alacarta.aragontelevision.es/programas/la-curiosidad-salvo-al-gato/genes-y-sostenibilidad-14122025-1132.
Nota de opinión sobre el artículo Global lifetime estimates of expected and preventable gastric cancers across 185 countries (Nat Med 2025; doi:10.1038/s41591-025-03793-6) publicada en 46 periódicos de España y Latino América. https://www.elconfidencial.com/salud/2025-07-07/incidencia-cancer-estomago-ninos-adolescentes_4167624/

Participación en Grupos

Grupo de Investigación Traslacional en Patología Digestiva del Gobierno de Aragón (Ref: B25_23R).
Grupo de Investigación Traslacional en Patología Digestiva del IIS Aragón (Ref: GIIS 27).
CIBER de enfermedades hepáticas y digestivas (CIBERehd).

Artículos publicados

Vacío

2025

Koebbe LL, Hess T, Haas SL, Gockel I, Piessen G, Latiano A, Pereira C, Malecka-Wojciesko E, Mokrowiecka A, Boccia S, Majewski M, Alakus H, Lanas Á, Pastorino R, Goetze TO, Elbe P, Kreuser N, Palmieri O, Tavano F, Bruns CJ, Glehen O, B D’Journo X, Gronnier C, Fabre JM, Sulpice L, Bujanda L, Moreira L, Heilmann-Heimbach S, Billmann M, Noethen MM, Cannizzaro R, Ghidini M, Hamann L, Aragones N, Dinis-Ribeiro M, Medeiros R, Al-Batran SE, Leja M, Kupcinskas J, García-González MA, Maj C, Venerito M, Schumacher J.

Exome sequencing points to pathogenic ATM variants in gastric cancer. European Journal of Human Genetics 2025. Doi: 10.1038/s41431-025-01994-8.

2024

Herrera-Pariente C., Bonjoch L., Muñoz J., Fernàndez G., Soares de Lima Y., Mahmood R., Cuatrecasas M., Ocaña T., López-Prades S., Diaz M., Llargués-Sistac G., Domínguez-Rovira X., Llach J., Luzko I., Díaz-Gay M., Lazaro C., García-González MA., Carrillo M., Quintero E., Sala N., Llort G., Aguilera L., Carot L., Diez-Redondo P., Jover R., Ramon y Cajal R., Cubiella J., Castells A., Balaguer F., Bujanda L., Castellví-Bel S., Moreira L. CTNND1 is involved in germline predisposition to early-onset gastric cancer by affecting cell-to-cell interactions. Gastric Cancer 2024;27:747-759. doi: 10.1007/s10120-024-01504-7. Q1

Aznar-Gimeno R., García-González MA., Muñoz-Sierra R., Carrera-Lasfuentes P., Rodrigalvarez-Chamarro M.V., Gonzalez-Muñoz C., Meléndez-Estrada E., Lanas A., del Hoyo-Alonso R. GastricAITool: A Clinical Decision Support Tool for the Diagnosis and Prognosis of Gastric Cancer. Biomedicines 2024;12:2162. doi: 10.3390/biomedicines12092162. Q1

2023

Hess T, Maj C, Gehlen J, Borisov O, Haas SL, Gockel I, Vieth M, Piessen G, Alakus H, Vashist Y, Pereira C, Knapp M, Schüller V, Quaas A, Grabsch HI, Trautmann J, Malecka-Wojciesko E, Mokrowiecka A, Speller J, Mayr A, Schröder J, Hillmer AM, Heider D, Lordick F, Pérez-Aísa Á, Campo R, Espinel J, Geijo F, Thomson C, Bujanda L, Sopeña F, Lanas Á, Pellisé M, Pauligk C, Goetze TO, Zelck C, Reingruber J, Hassanin E, Elbe P, Alsabeah S, Lindblad M, Nilsson M, Kreuser N, Thieme R, Tavano F, Pastorino R, Arzani D, Persiani R, Jung JO, Nienhüser H, Ott K, Schumann RR, Kumpf O, Burock S, Arndt V, Jakubowska A, Ławniczak M, Moreno V, Martín V, Kogevinas M, Pollán M, Dąbrowska J, Salas A, Cussenot O, Boland-Auge A, Daian D, Deleuze JF, Salvi E, Teder-Laving M, Tomasello G, Ratti M, Senti C, De Re V, Steffan A, Hölscher AH, Messerle K, Bruns CJ, Sīviņš A, Bogdanova I, Skieceviciene J, Arstikyte J, Moehler M, Lang H, Grimminger PP, Kruschewski M, Vassos N, Schildberg C, Lingohr P, Ridwelski K, Lippert H, Fricker N, Krawitz P, Hoffmann P, Nöthen MM, Veits L, Izbicki JR, Mostowska A, Martinón-Torres F, Cusi D, Adolfsson R, Cancel-Tassin G, Höblinger A, Rodermann E, Ludwig M, Keller G, Metspalu A, García-González MA, Venerito M, Schumacher J. Dissecting the genetic heterogeneity of gastric cancer. EBioMedicine. 2023;92:104616. doi: 10.1016/j.ebiom.2023.104616.

Grasa L, Chueca E, Arechavaleta S, García-González MA, Sáenz MÁ, Valero A, Hördnler C, Lanas Á, Piazuelo E. Antitumor effects of lactate transport inhibition on esophageal adenocarcinoma cells. J Physiol Biochem. 2023;79:147-161. doi: 10.1007/ s13105-022-00931-3.

2022

Gargallo-Puyuelo CJ, Aznar-Gimeno R, Carrera-Lasfuentes P, Lanas Á, Ferrández Á, Quintero E, Carrillo M, Alonso-Abreu I, Esteban LM, de la Vega Rodrigálvarez-Chamarro M, Del Hoyo-Alonso R, García-González MA. Predictive Value of Genetic Risk Scores in the Development of Colorectal Adenomas. Dig Dis Sci. 67
(8); 4049-4058 (2022). PMID: 34387810. DOI: 10.1007/s10620-021-07218-5.

2021

Gargallo-Puyuelo CJ, Lanas Á, Carrera-Lasfuentes P, Ferrández Á, Quintero E, Carrillo M, Alonso-Abreu I, García-González MA. Familial colorectal cancer and genetic susceptibility: Colorectal risk variants in first-degree relatives of patients with colorectal cancer. Clin Transl Gastroenterol. 12:e00301 (2021). PMID: 33534415. DOI: 10.14309/ctg.0000000000000301.

Gargallo-Puyuelo CJ, Aznar-Gimeno R, Carrera-Lasfuentes P, Lanas Á, Ferrández Á, Quintero E, Carrillo M, Alonso-Abreu I, Esteban LM, de la Vega Rodrigálvarez-Chamarro M, Del Hoyo-Alonso R, García-González MA. Predictive Value of Genetic Risk Scores in the Development of Colorectal Adenomas. Dig Dis Sci. (2021) (Online ahead of print). PMID: 34387810. DOI: 10.1007/s10620-021-07218-5.

2017-2020

2020

Chueca E, Valero A, Hördnler C, Puertas A, Carrera P, García-González MA, Strunk M, Lanas A, Piazuelo E. Quantitative analysis of p16 methylation in Barrett’s carcinogenesis. Ann Diagn Pathol. 47:151554. (2020) PMID: 32570024.

2019

Carriazo S P-G, M. V.;Cordido, A.;Garcia-Gonzalez, M. A.;Sanz, A. B.;Ortiz, A.;Sanchez-Nino, M. D. Dietary Care for ADPKD Patients: Current Status and Future Directions. Nutrients 2019; 11(7). DOI 10.3390/nu11071576. ISSN:2072-6643

Gargallo C J L, A.;Carrera-Lasfuentes, P.;Ferrandez, A.;Quintero, E.;Carrillo, M.;Alonso-Abreu, I.;Garcia-Gonzalez, M. A. Genetic susceptibility in the development of colorectal adenomas according to family history of colorectal cancer. Int J Cancer 2019; 144 (3):489-502. DOI 10.1002/ijc.31858. ISSN: 0020-7136

2018

Heinrichs SKM, Hess T, Becker J, Hamann L, Vashist YK, Butterbach K, Schmidt T, Alakus H, Krasniuk I, Höblinger A, Lingohr P, Ludwig M, Hagel AF, Schildberg CW, Veits L, Gyvyte U, Weise K, Schüller V, Böhmer AC, Schröder J, Gehlen J, Kreuser N, Hofer S, Lang H, Lordick F, Malfertheiner P, Moehler M, Pech O, Vassos N, Rodermann E, Izbicki JR, Kruschewski M, Ott K, Schumann RR, Vieth M, Mangold E, Gasenko E, Kupcinskas L, Brenner H, Grimminger P, Bujanda L, Sopeña F, Espinel J, Thomson C, Pérez-Aísa Á, Campo R, Geijo F, Collette D, Bruns C, Messerle K, Gockel I, Nöthen MM, Lippert H, Ridwelski K, Lanas A, Keller G, Knapp M, Leja M, Kupcinskas J, García-González MA, Venerito M, Schumacher J.

Heinrichs, Hess, Leja, Kupcinskas, García-González, Venerito and Schumacher authors contributed equally to this work.

Evidence for PTGER4, PSCA and MBOAT7 as risk genes for gastric cancer on the genome and transcriptome level. Cancer Med 2018; 7:5057-65.

2017

a) Carrera-Lasfuentes P, Lanas A, Bujanda L, Strunk M, Quintero E, Santolaria S, Benito R, Sopeña F, Piazuelo E, Thomson C, Pérez-Aísa A, Nicolás-Pérez D, Hijona E, Espinel J, Campo R, Manzano M, Geijo F, Pellisé M, Zaballa M, González-Huix F, Espinós J, Titó Ll, Barranco L, D´Amato M, García-González MA. Relevance of DNA repair gene polymorphisms on gastric cancer risk and phenotype. Oncotarget 2017; 8:35848-62.

Factor impacto: 5.008 (WOS 2016)

Subject categories: ONCOLOGY Posición: 36/213 Cuartil: 1

Subject categories: CELL BIOLOGY Posición: 43/187 Cuartil: 1

b) Jiménez P, Chueca E, Arruebo M, Strunk M, Solanas E, Serrano T, García-González MA, Lanas A. Proton Pump Inhibitors Display Antitumor Effects in Barrett’s Adenocarcinoma Cells. Pharmacol 2017; 8:321 doi: 10.3389/fphar.2017.00321. eCollection.

Factor impacto: 4.400

Subject categories: PHARMACOLOGY & PHARMACY. Posición: 33/255. Cuartil: 1

c) Gargallo CJ, Lanas A, Carrera-Lasfuentes P, Ferrández A., Quintero E., Carrillo M, Alonso-Abreu I, García-González MA. Influence of family history of colorectal cancer in the genetic susceptibility to colorectal adenomas development. Enviado a GUT referencia número: gutjnl-2017-315461.

d) Schumacher J; Heinrichs S; Hess T; Becker J; Hamann L; Vashist Y; Butterbach; Schmidt T; Alakus H; Krasniuk I; Höblinger A; Lingohr P; Ludwig M; Hagel A; Schildberg C; Veits L; Gyvyte U; Schüller V; Böhmer A; Schröder J; Gehlen J; Kreuser N; Lang H; Lordick F; Malfertheiner P; Moehler M; Pech O; Vassos N; Rodermann E; Izbicki A; Kruschewski M; Ott K; Schumann R; Vieth M; Mangold E; Gasenko E; Kupcinskas L; Brenner H; Grimminger P; Bujanda L; Sopena F; Espinel J; Thomson C; Perez-Aisa A; Campo R; Geijo F; Collette D; Bruns C; Gockel I; Nöthen M; Lippert H; Ridwelski K; Lanas A; Keller G; Knapp M; Leja M; Kupcinskas J; Garcia-Gonzalez MA; Venerit M. Evidence for PTGER4, PSCA and MBOAT7 as risk genes for gastric cancer on the genome and transcriptome level. Enviado a Gastric Cancer, referencia número: GCAN-D-18-00113.