Epidemiología molecular de la tuberculosis

Grupos de investigación

Foto del grupo de investigación EPIDEMIOLOGÍA MOLECULAR<br />
DE LA TUBERCULOSIS

Hemos introducido la secuenciación del genoma de forma sistemática para una mayor diferenciación y un seguimiento más fiable de la tuberculosis en nuestra población

Equipo Científico

INVESTIGADOR PRINCIPAL

Sofía Samper

EQUIPO

Investigadores asociados: María José Iglesias, Isabel Otal, Xunxiao Lin, Alberto Cebollada.  

 

Actividad del grupo de investigación

El grupo participa en la vigilancia molecular de la tuberculosis en la CCAA de Aragón, en colaboración con los microbiólogos de los laboratorios de micobacterias de los hospitales de Aragón y con Salud Pública. Realiza el estudio de genotipado de las cepas de M. tuberculosis aisladas en Aragón. 

El grupo trabaja en la caracterización de las cepas causantes de brotes en nuestra población y estudia los elementos diferenciales en sus genomas. Estudia las resistencias y la filogenia de los aislados de M. tuberculosis.

Participa en la formación continuada de estudiantes y personal del Sistema Nacional de Salud.

Participa en la Red Europea de Laboratorios de Referencia de Micobacterias (ERLTB-Net3) que finaliza este año. 

Centro

UIT del Hospital Universitario del Miguel Sevet

Programas

  • Enfermedades infecciosas e inflamación

Líneas de investigación

  • Epidemiología molecular de la tuberculosis

Actividad y resultados más relevantes del año

En 2024 el grupo ha continuado la colaboración con Salud Pública de Aragón en la vigilancia molecular de la tuberculosis, genotipando las cepas de M. tuberculosis. El número de aislados de este año ha roto su tendencia descendente. 

  • Hemos estudiado los casos de tuberculosis que sufren recaída, ya sea por reactivación de su enfermedad o por reinfección.
  • Hemos trabajado con estudiantes del grado de Bioinformática de la Universidad de San Jorge en el desarrollo de programas que identifiquen de forma sistemática en los ficheros resultantes de la secuenciación del genoma.

Y nos hemos adentrado en el mundo de los datos de vida real, en BIGAN, necesitamos procesarlos y trabajarlos para obtener resultados sobre la tuberculosis en nuestra población y las comorbilidades, conocer los factores de riesgo involucrados que puedan ayudar en el manejo de estos pacientes.

Artículos publicados

Vacío

2023

Deciphering the Tangible Spatio-Temporal Spread of a 25-Year Tuberculosis Outbreak Boosted by Social Determinants. López MG, Campos-Herrero MI, Torres-Puente M, Cañas F, Comín J, Copado R, Wintringer P, Iqbal Z, Lagarejos E, Moreno-Molina M, Pérez-Lago L, Pino B, Sante L, García de Viedma D, Samper S, Comas I. Microbiol Spectr. 2023 Feb 14;11(2):e0282622. doi: 10.1128/spectrum.02826-22. PMID: 36786614 Free PMC article.

Rapid Identification of Lineage and Drug Resistance in Clinical Samples of Mycobacterium tuberculosis. Comín J, Viñuelas J, Lafoz C, Cebollada A, Ibarz D, Iglesias MJ, Samper S. Microorganisms. 2023 May 31;11(6):1467. doi: 10.3390/microorganisms11061467. PMID: 37374968 Free PMC article.

Transcriptomic profile of the most successful Mycobacterium tuberculosis strain in Aragon, the MtZ strain, during exponential and stationary growth phases. Comín J, Campos E, Gonzalo-Asensio J, Samper S.

2022

Millán-Lou MI, López C, Bueno J, Pérez-Laguna V, Lapresta C, Fuertes ME, Rite S, Santiago M, Romo M, Samper S, Cebollada A, Oteo-Iglesias J, Rezusta A. Successful control of Serratia marcescens outbreak in a neonatal unit of a tertiary-care hospital in Spain. Enferm Infecc Microbiol Clin (Engl Ed). 2022 May;40(5):248-254. doi: 10.1016/j. eimce.2021.05.014. PMID: 35577443.

Comín J, Otal I, Samper S. In-depth Analysis of IS6110 Genomic Variability in the Mycobacterium tuberculosis Complex.
Front Microbiol. 2022 Feb 24;13:767912. doi: 10.3389/fmicb.2022.767912. PMID: 35283840; PMCID: PMC8912993.

Comín J, Cebollada A, Ibarz D, Viñuelas J, Sahagún J, Torres L, Iglesias MJ, Samper S. Analysis of the twenty-six largest outbreaks of tuberculosis in Aragon using whole-genome sequencing for surveillance purposes. Sci Rep. 2022 Nov 5;12(1):18766. doi: 10.1038/s41598- 022-23343-1. PMID: 36335223; PMCID: PMC9637126.

Comín J, Cebollada A; Aragonese Working Group on Molecular Epidemiology of Tuberculosis (EPIMOLA); Samper S.
Estimation of the mutation rate of Mycobacterium tuberculosis in cases with recurrent tuberculosis using whole genome sequencing. Sci Rep. 2022 Oct 6;12(1):16728. doi: 10.1038/s41598-022-21144-0. Erratum in: Sci Rep. 2023 Feb 27;13(1):3367. PMID: 36202945; PMCID: PMC9537313.

Comín J, Madacki J, Rabanaque I, Zúñiga-Antón M, Ibarz D, Cebollada A, Viñuelas J, Torres L, Sahagún J, Klopp C, Gonzalo-Asensio J, Brosch R, Iglesias MJ, Samper
S. The MtZ Strain: Molecular Characteristics and Outbreak Investigation of the Most Successful Mycobacterium tuberculosis Strain in Aragon Using Whole-Genome Sequencing. Front Cell Infect Microbiol. 2022 May24;12:887134. doi: 10.3389/fcimb.2022.887134. PMID: 35685752; PMCID: PMC9173592.

2021

Gonzalo-Asensio J, Pérez I, Aguiló N, Uranga S, Picó A, Lampreave C, Cebollada A, Otal I, Samper S, Martín C. New insights into the transposition mechanisms of  IS6110 and its dynamic distribution between Mycobacterium tuberculosis Complex lineages. PLoS Genet. 2018 Apr 12;14(4):e1007282. doi: 10.1371/journal.pgen.1007282. PubMed PMID: 29649213.

Arregui S, Iglesias MJ, Samper S, Marinova D, Martin C, Sanz J, Moreno Y. Data-driven model for the assessment of Mycobacterium tuberculosis transmission in evolving demographic structures. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018 Apr 3;115(14):E3238-E3245. doi: 10.1073/pnas.1720606115. PubMed PMID: 29649213.

Samper S, González-Martin J. Microbiological diagnosis of infections caused by the genus Mycobacterium. Enferm Infecc Microbiol Clin. 2018 Feb;36(2):104-111. doi: 10.1016/j.eimc.2017.11.009. PubMed PMID: 29287920.

Pérez-Laguna V, García-Luque I, Ballesta S, Pérez-Artiaga L, Lampaya-Pérez V, Samper S, Soria-Lozano P, Rezusta A, Gilaberte Y. Antimicrobial photodynamic activity of Rose Bengal, alone or in combination with Gentamicin, against planktonic and biofilm Staphylococcus aureus. Photodiagnosis Photodyn Ther. 2018 Mar;21:211-216. doi: 10.1016/j.pdpdt.2017.11.012. PubMed PMID: 29196246.

2016-2020

2019

Moreno B B, R.;Andres-Lasheras, S.;Sevilla, E.;Samper, S.;Morales, M.;Vargas, A.;Chirino-Trejo, M.;Badiola, J. J. Antimicrobial Susceptibilities and Phylogenetic Analyses of Enterococcus hirae Isolated from Broilers with Valvular Endocarditis. Avian Dis 2019; 63 (2):   318-324. DOI 10.1637/11986-102418-Reg.1. ISSN: 0005-2086.

Perez-Lago L C-H, M. I.;Canas, F.;Copado, R.;Sante, L.;Pino, B.;Lecuona, M.;Gil, O. D.;Martin, C.;Munoz, P.;Garcia-de-Viedma, D.;Samper, S. A Mycobacterium tuberculosis Beijing strain persists at high rates and extends its geographic boundaries 20 years after importation. Sci Rep 2019; 9 (1): 4687. DOI 10.1038/s41598-019-40525-6. ISSN: 2045-2322.

2016

Sagasti S, et al. In-depth analysis of the genome sequence of a clinical, extensively drug-resistant Mycobacterium bovis strain. Tuberculosis (Edinb).100:46-52 (2016)

Nebreda T,  et al. Peritoneal tuberculosis due to Mycobacterium caprae. IDCases. 5;4:50-2 (2016)

Nikolayevskyy V, et al. External Quality Assessment for Tuberculosis Diagnosis and Drug Resistance in the European Union: A Five Year Multicentre Implementation Study. PLoS One. 7;11(4):e0152926(2016)

Molina-Moya B , et al. Evaluation of GenoFlow DR-MTB Array Test for Detection of Rifampin and Isoniazid Resistance in Mycobacterium tuberculosis. J Clin Microbiol.;54(4):1160-3 (2016)

Millán-Lou MI, , et al. Mycobacterial diversity causing multi- and extensively drug-resistant tuberculosis in Djibouti, Horn of Africa. Int J Tuberc Lung Dis. 20, 150-153 (2016)

Proyectos activos

PROYECTOS:

  • Sociedad Española de Neumología y Cirugía Torácica (SEPAR), ”Seguimiento de pacientes con tuberculosis resistente en España” 01/06/2021-24
  • CIBER ENFERMEDADES RESPIRATORIAS (CIBERES), 31/12/2020-24: “Innovation in Tuberculosis” INNOVA4TB  Marie Skodowska Curie Research and Innovation Staff Exchange. H2020
  • Advance TB, Accion COST.  
  • SEIPA

Participación en Red:

    • CIBER Enfermedades Respiratorias desde 2007. Instituto de Salud Carlos III. 
    • Grupo de Genética de Micobacterias desde 1992. B35_20R. Gobierno de Aragón desde 2002.
    • Grupo de Genética de Micobacterias. GIIS049. IIS Aragón.

Fecha actualización

Marzo 2025