Epidemiología molecular de la tuberculosis

Grupos de investigación

Foto del grupo de investigación EPIDEMIOLOGÍA MOLECULAR<br />
DE LA TUBERCULOSIS

Disponemos de una amplia base con los perfiles genómicos de las cepas de tuberculosis que discurren entre la población aragonesa, lo que nos facilita informar de brotes a los servicios de vigilancia y analizar las posibles ventajas de determinadas cepas para su transmisión

Equipo Científico

INVESTIGADOR PRINCIPAL

Sofía Samper

EQUIPO

Investigadores asociados: Mª José Iglesias, Profesora de Universidad en área de Preventiva; Xunxiao Lin, Neumóloga; Isabel Otal, Profesora de Universidad en área de Microbiología; Alberto Cebollada, Bioestadístico y Bioinformático; Daniel Ibarz, enfermero.

 

Actividad del grupo de investigación

La principal actividad del grupo es la epidemiología molecular de la tuberculosis, el análisis de cepas, realizar el seguimiento de la evolución y transmisión de las mismas. 

Centro

UIT del Hospital Universitario del Miguel Sevet

Programas

  • Enfermedades infecciosas e inflamación

Líneas de investigación

  • Epidemiología molecular de la tuberculosis

Actividad y resultados más relevantes del año

Proyectos principales activos durante el año 2025

Sofía Samper es coordinadora de la Línea de Tuberculosis de CIBER de Enfermedades Respiratorias-CIBERES. (https://lnkd.in/dQQVdytP). Miembro del grupo  CB06/06/0020, IP: Carlos Martín.

Action CA21164 – COST – Towards an improvement in diagnostics and treatment strategies for TB control – ADVANC. Miembro participante. 

Hallazgos o resultados relevantes del año

A lo largo de 2025 hemos analizado la situación y el tratamiento de la tuberculosis resistente, al menos, a Rifampicina en España mediante un estudio observacional ambi-perspectivo (retrospectivo y prospectivo), multicéntrico, que incluyó a pacientes diagnosticados entre enero de 2019 y julio de 2023.

En total, se recopiló información de 98 pacientes. El estudio puso de manifiesto las dificultades para obtener autorización sanitaria o prescribir los nuevos fármacos, como bedaquilina y delamanid. Aun así, la mayoría de los pacientes fueron tratados con éxito gracias a regímenes individualizados y llevados a cabo por expertos.

En cambio, los pacientes con tuberculosis Pre-XDR, que también presentaban resistencia a fluoroquinolonas, experimentaron mayores complicaciones y tasas de éxito más bajas. Nuestra participación se centró en la recopilación de casos y en la coordinación entre los neumólogos e infectólogos responsables del tratamiento y el coordinador del proyecto.

Por otro lado, estudiamos los casos de reinfección de tuberculosis en Aragón (región de baja incidencia de tuberculosis) con el objetivo de comprender su relevancia en el contexto de la posible implementación de una vacuna frente a la tuberculosis. El 2,30% de los casos registrados presentaron al menos un segundo episodio. Entre ellos, diferenciamos las recaídas debidas a reactivación del episodio previo y las debidas a reinfección.

Observamos que la recurrencia es rara y principalmente debida a la reactivación de un episodio previo, estando ligada la reinfección a un estado de salud comprometido. Este trabajo será publicado el próximo año.

Seguimos interesados en el estudio de la transmisión de la tuberculosis. El genotipado sistemático de las cepas nos ha permitido caracterizar varios brotes detectados en entornos laborales, familiares y sociales.

Asimismo, organizamos en Zaragoza una Jornada Científica del Programa de Infecciones Respiratorias de CIBER de Enfermedades Respiratorias (CIBERES), con la participación de 65 investigadores de distintos grupos de CIBERES y de otras áreas temáticas de CIBER: CIBERESP, CIBERINFEC y CIBERBBN. Durante dos días de reflexión y mirada al futuro, cerca de 100 investigadores especializados en micobacterias compartimos conocimientos y experiencias, fortaleciendo así la colaboración científica entre los miembros de la red de excelencia MycoNET.

Artículos publicados

Vacío

2025

José-María García-García; Teresa Rodrigo-Sanz; José-Antonio Gullón-Blanco; Xavier Casas; Joan-Pau Millet; Sarai Quirós Fernández; Miguel-José Martínez Lirola; Alberto Mangas Moro; Ángel Domínguez Castellano; Enrique Navas Elorza; Magnolia Nieto Marcos; Francesc Arasa Panisello; Pilar Bermúdez Ruiz; Manuel García Cabrera; Francisco Sanz Herrero; Isabel Suárez Toste; Luis Adolfo Urrelo Cerrón; María Espiau Guarner; Antoni Soriano Arandes; Miguel Arias Guillén; José-Joaquín Cebrián Gallardo; Julia-Amaranta García-Fuertes;  Mª Asunción Pérez-Jacoiste Asín; María Somoza González; Juan-José Palacios Gutiérrez; Fernando Alcaide; Sofía Samper Blasco; Eva Tabernero Huguet; Joan A. Caylà; Juan Ruiz Manzano; José Antonio Caminero Luna. Rifampicin-resistant tuberculosis in Spain. ERJ Open Research. DOI: 10.1183/23120541.00941-202. https://lnkd.in/exF2G7vc

Rapid Identification of Lineage and Drug Resistance in Clinical Samples of Mycobacterium tuberculosis. Comín J, Viñuelas J, Lafoz C, Cebollada A, Ibarz D, Iglesias MJ, Samper S. Microorganisms. 2023 May 31;11(6):1467. doi: 10.3390/microorganisms11061467. PMID: 37374968 Free PMC article.

Transcriptomic profile of the most successful Mycobacterium tuberculosis strain in Aragon, the MtZ strain, during exponential and stationary growth phases. Comín J, Campos E, Gonzalo-Asensio J, Samper S.

2023

Deciphering the Tangible Spatio-Temporal Spread of a 25-Year Tuberculosis Outbreak Boosted by Social Determinants. López MG, Campos-Herrero MI, Torres-Puente M, Cañas F, Comín J, Copado R, Wintringer P, Iqbal Z, Lagarejos E, Moreno-Molina M, Pérez-Lago L, Pino B, Sante L, García de Viedma D, Samper S, Comas I. Microbiol Spectr. 2023 Feb 14;11(2):e0282622. doi: 10.1128/spectrum.02826-22. PMID: 36786614 Free PMC article.

Rapid Identification of Lineage and Drug Resistance in Clinical Samples of Mycobacterium tuberculosis. Comín J, Viñuelas J, Lafoz C, Cebollada A, Ibarz D, Iglesias MJ, Samper S. Microorganisms. 2023 May 31;11(6):1467. doi: 10.3390/microorganisms11061467. PMID: 37374968 Free PMC article.

Transcriptomic profile of the most successful Mycobacterium tuberculosis strain in Aragon, the MtZ strain, during exponential and stationary growth phases. Comín J, Campos E, Gonzalo-Asensio J, Samper S.

2022

Millán-Lou MI, López C, Bueno J, Pérez-Laguna V, Lapresta C, Fuertes ME, Rite S, Santiago M, Romo M, Samper S, Cebollada A, Oteo-Iglesias J, Rezusta A. Successful control of Serratia marcescens outbreak in a neonatal unit of a tertiary-care hospital in Spain. Enferm Infecc Microbiol Clin (Engl Ed). 2022 May;40(5):248-254. doi: 10.1016/j. eimce.2021.05.014. PMID: 35577443.

Comín J, Otal I, Samper S. In-depth Analysis of IS6110 Genomic Variability in the Mycobacterium tuberculosis Complex.
Front Microbiol. 2022 Feb 24;13:767912. doi: 10.3389/fmicb.2022.767912. PMID: 35283840; PMCID: PMC8912993.

Comín J, Cebollada A, Ibarz D, Viñuelas J, Sahagún J, Torres L, Iglesias MJ, Samper S. Analysis of the twenty-six largest outbreaks of tuberculosis in Aragon using whole-genome sequencing for surveillance purposes. Sci Rep. 2022 Nov 5;12(1):18766. doi: 10.1038/s41598- 022-23343-1. PMID: 36335223; PMCID: PMC9637126.

Comín J, Cebollada A; Aragonese Working Group on Molecular Epidemiology of Tuberculosis (EPIMOLA); Samper S.
Estimation of the mutation rate of Mycobacterium tuberculosis in cases with recurrent tuberculosis using whole genome sequencing. Sci Rep. 2022 Oct 6;12(1):16728. doi: 10.1038/s41598-022-21144-0. Erratum in: Sci Rep. 2023 Feb 27;13(1):3367. PMID: 36202945; PMCID: PMC9537313.

Comín J, Madacki J, Rabanaque I, Zúñiga-Antón M, Ibarz D, Cebollada A, Viñuelas J, Torres L, Sahagún J, Klopp C, Gonzalo-Asensio J, Brosch R, Iglesias MJ, Samper
S. The MtZ Strain: Molecular Characteristics and Outbreak Investigation of the Most Successful Mycobacterium tuberculosis Strain in Aragon Using Whole-Genome Sequencing. Front Cell Infect Microbiol. 2022 May24;12:887134. doi: 10.3389/fcimb.2022.887134. PMID: 35685752; PMCID: PMC9173592.

2021

Gonzalo-Asensio J, Pérez I, Aguiló N, Uranga S, Picó A, Lampreave C, Cebollada A, Otal I, Samper S, Martín C. New insights into the transposition mechanisms of  IS6110 and its dynamic distribution between Mycobacterium tuberculosis Complex lineages. PLoS Genet. 2018 Apr 12;14(4):e1007282. doi: 10.1371/journal.pgen.1007282. PubMed PMID: 29649213.

Arregui S, Iglesias MJ, Samper S, Marinova D, Martin C, Sanz J, Moreno Y. Data-driven model for the assessment of Mycobacterium tuberculosis transmission in evolving demographic structures. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018 Apr 3;115(14):E3238-E3245. doi: 10.1073/pnas.1720606115. PubMed PMID: 29649213.

Samper S, González-Martin J. Microbiological diagnosis of infections caused by the genus Mycobacterium. Enferm Infecc Microbiol Clin. 2018 Feb;36(2):104-111. doi: 10.1016/j.eimc.2017.11.009. PubMed PMID: 29287920.

Pérez-Laguna V, García-Luque I, Ballesta S, Pérez-Artiaga L, Lampaya-Pérez V, Samper S, Soria-Lozano P, Rezusta A, Gilaberte Y. Antimicrobial photodynamic activity of Rose Bengal, alone or in combination with Gentamicin, against planktonic and biofilm Staphylococcus aureus. Photodiagnosis Photodyn Ther. 2018 Mar;21:211-216. doi: 10.1016/j.pdpdt.2017.11.012. PubMed PMID: 29196246.

2016-2020

2019

Moreno B B, R.;Andres-Lasheras, S.;Sevilla, E.;Samper, S.;Morales, M.;Vargas, A.;Chirino-Trejo, M.;Badiola, J. J. Antimicrobial Susceptibilities and Phylogenetic Analyses of Enterococcus hirae Isolated from Broilers with Valvular Endocarditis. Avian Dis 2019; 63 (2):   318-324. DOI 10.1637/11986-102418-Reg.1. ISSN: 0005-2086.

Perez-Lago L C-H, M. I.;Canas, F.;Copado, R.;Sante, L.;Pino, B.;Lecuona, M.;Gil, O. D.;Martin, C.;Munoz, P.;Garcia-de-Viedma, D.;Samper, S. A Mycobacterium tuberculosis Beijing strain persists at high rates and extends its geographic boundaries 20 years after importation. Sci Rep 2019; 9 (1): 4687. DOI 10.1038/s41598-019-40525-6. ISSN: 2045-2322.

2016

Sagasti S, et al. In-depth analysis of the genome sequence of a clinical, extensively drug-resistant Mycobacterium bovis strain. Tuberculosis (Edinb).100:46-52 (2016)

Nebreda T,  et al. Peritoneal tuberculosis due to Mycobacterium caprae. IDCases. 5;4:50-2 (2016)

Nikolayevskyy V, et al. External Quality Assessment for Tuberculosis Diagnosis and Drug Resistance in the European Union: A Five Year Multicentre Implementation Study. PLoS One. 7;11(4):e0152926(2016)

Molina-Moya B , et al. Evaluation of GenoFlow DR-MTB Array Test for Detection of Rifampin and Isoniazid Resistance in Mycobacterium tuberculosis. J Clin Microbiol.;54(4):1160-3 (2016)

Millán-Lou MI, , et al. Mycobacterial diversity causing multi- and extensively drug-resistant tuberculosis in Djibouti, Horn of Africa. Int J Tuberc Lung Dis. 20, 150-153 (2016)

Fecha actualización

Abril 2026